CDS

Accession Number TCMCG083C20027
gbkey CDS
Protein Id KMZ75927.1
Location complement(join(242509..242620,242706..242778,244494..244914,245267..245620,249357..249515,250311..250526,254200..254403,258899..259108,259210..262530,262629..262780,267879..268365,269523..270402,270481..271538))
Organism Zostera marina
locus_tag ZOSMA_109G00170

Protein

Length 2548aa
Molecule type protein
Topology linear
Data_file_division PLN
dblink BioProject:PRJNA41721, BioSample:SAMN00991190
db_source LFYR01000112.1
Definition Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1 [Zostera marina]
Locus_tag ZOSMA_109G00170

EGGNOG-MAPPER Annotation

COG_category L
Description isoform X1
KEGG_TC -
KEGG_Module -
KEGG_Reaction -
KEGG_rclass -
BRITE ko00000        [VIEW IN KEGG]
ko01000        [VIEW IN KEGG]
ko03009        [VIEW IN KEGG]
KEGG_ko ko:K07766        [VIEW IN KEGG]
ko:K14861        [VIEW IN KEGG]
EC 3.6.1.52        [VIEW IN KEGG]        [VIEW IN INGREDIENT]
KEGG_Pathway -
GOs -

Sequence

CDS:  
ATGGATGAACAGGTTGAGGTCGTTGCAATGACGACGTTAAAAGTGTTACTAAAGAATGTACTCTCTACAGAATTTGAGATATACTCAGAAGCGTCAAAGGACTTGGCGAAATTATTTAAGCGAGATTCTTGTGGGGAGTTACTCCGGCAGTACATTCGATCTTCGGAAAATTGTATGGAGCTTTTAGAAATTTGGAAGATGCGTCGTGGGAAGCCTGGAATGGTGTATGTATTTAAATTGATAACTGCAGTTCTGGATCATTCATTTGGAAAATCCCGTATGAGTGGGATTATGAGGAATCTAGATTCATTTGCTCGTGGTATTATTTTTGAAAAATTAGAGGATGTTTACCTGGAGATGAAAAGTGAACAGGCCAAGCGCCAGAATGCTGCACTCCGTCTCTTGGCATCCATTGTCAGGCGTGGAACGGGTTTGGCATCAGACGTTGAGAAAACATTTGATTTTGATTTATCCGTGCTTCCTAAACTATCAGGTAATCAGAAGGTTAAATGGAAGAAGTACCACGAAACATATTCGACAAGGAATTCCTTTGTCAGATTTGCCATGTCTTTTCTAGAAGTTGGGAACCCAAGACTTTTGGGGATTGTAATTAGGCATAAAGTTTTATATGCCGGAGTCCTCCAGGGATTAACAAAGGACGATTCAGATACTCTCGTTTATGTTTTGTCCATTCTCAAAGATAGAGTTTTGCCATCTAGTTCCTTGATACGACCTGGTCTTCGCAGTCTCCTCTTTGGAGAGGGAACACTTGAGCAGCTAAGCCTTATTTCAGGGAACCTAGAAGGTGGACATGCTTCTGATTTGGCACATGAGGTTCTAGTTATGGTGTGTACAGATCCATGTAATGGGCTGATGCCAAATTCTAATTTAATGGGCAATAAAAAAAGGCTCTTAAAGTTCATGTTTAAATTGAAGGCTATAGAAGTTATTTATCACAAAGATTTGCTATTGACTGTTGTGAAGGGAAAGCCATTTCTGTGTGCAAAGTATCTTAAGAAATTCCCCTACAATCTTGATCCAAACATGTCACCTGAATGGTTTTCAGCTATTTCTCTCACCACTGACTTGATTTCATCAACTATTTCTAGTTTTACATTCAATTTTCTTTCTTCTACATCTTCACATGATCCACCTGATTTTAAGGGTAAAGAGATGCAGTATATTCTGAAATCCATCCTTCCCAATCTATTTACTCGCTCAGTATGCAATAAGGGTTTACTCCACACTGACATTCTAGTAAAACATGGTGCCTTAAGGCTTGTATTGGAGATACTAAAGGCTCTAGATAAGTTTTCTATTCAAATAGATTTAGTAGCAAAAATCAATTGTTCAGATGAAGTAGGTTGTTTTGAAAGTGTTCCAGTTGACTGGAATGGTCCTTCAGGGTTTGGATTCTTTGGTAATAATTTTTGCTATAATTTTCATCCGAAAAGTCACATTGCTCCAAAAAATGATCAATCATTGATGCAGAAATGGATGTCTTTTAAGCAAGACTTGCAAGATGAAGTTGGTAACTTCCTCCCTGATCTTCAAGTTCTTCTAAACTTGCTTGCATCTTCCCAGAGGATGATTAAGTCTTCTTTGAACATTGAAGGTTCACGTGATTCTAGGTTCAACATTAAGAGATGTCTTCATTTACCTGAAGTTAGTCGTAAGAGATTGAAGTCTAGTACCAGTTCAATAAGTGACGGCGTTGACATTATCATAAGTGGGGTTAATTTAGAAAATAACTACAACACACTTGAGGAAAACAATGATGTAAAAGTTTCCGAGGATATGGAATTGGAAGAAACCAATGTAAAAATGTTAGTAGATGAAATATGGGGCTCTTCTAAAGCTGATATCATCACGACCAAGACGGAAGATTTGGACATATTCTTTTACACAAAGTTGCTTGATACCCTTGCTTTATATATAAAGAGAGTACCAAAAGCTTTGGGTGGATCTTTTGACTTTTTTAAGATTTTGCCAGATGATCCTTCAAGCTTATCTTCTTTTCATCTGGATTCTGTATTATCATTATTAGTTGAATATACTGGACAATCATCTGTGTCCAACCATCCAGTTAGAGTACCTGATATGATGTACAAGCATTTGCTTCCACTGATTAACTTACTTTCCCATACACAGGGTGGAACCCAAGATAAAGCATACGTTTTAGTAAGGTCAGCCATGTTAAGCACTGGTGCCTTTGATCAGAATGTATCAGAAATAGATGTGTGGTTACTGTTTTTACCTAGTCATTGCGAGAAAGAAAACTATGCTTCAAAGAAAAAAACAAACAATAAATGGGTGATCATCGTCATTTCATTTTTATGTGACGCTGTTTCAACAATAGGAAATAATTTATTTAAAAAGTGGGATCACATGCGTGTTCTTATCTCCCAGTTGAAAGAATTTCGTGACGAGGTCCCTACTTATAGTCCGCTTGTCCCAATCATCATAGAAAAGTGCATCAGGTTGCTGAAGTCGGACTCTGGATCCTTTAAATTATTTGAAAAAACCATGGTTTCCTTATATGTGTGCAATTCCTTAATTTATCTTTTGCAGAGTCAGGCACTCCCAGGAAGTTTACCTCATCTGATCAATTTACTTTTATCTGAGAAGTCTAACAATACATATATAATGGATGACGATTCTAATAATTCACAATGGAGGCCAGTAAAGAGTTTATTGTATTCTGCAAGGTGTATTTTGCATCAGCAATCTTCTGATCATTTGTTATATATACCAGAAAAGATAAAAAAAGGCAATGGTGGATTGTTGTACTCTGCACTCAATAGTGTGAAGGAGATTTTAGCAAGTGAACATAAATTGGATTTGGATGAAGCTGCCGTTTCTTTATTATCCTCTGTTATATGTGCGACTCTTGACGATATACTGAATTATTTCCCTTTACTAGTTATTGTTGTTGAACAACTTTGGGGAGCGCACACACAAATTTTATCGTCAATTCTTTTTTGCGAGTGGAATGTTCTTTCTGTTGTTTCTAATCTTCGTCCAGACATGTTATTTTCTAGTTTGGATGGCATTGAAGATACAATGAGCAACAACCATGAATCTGCAACCACAACATCCATTTCTATCTGGGAAACCATTCCTTTTCATTCCATATTTACTCTTGCCACAATCCTTTGCAAATGTAATGTTGTATTATCCACAAAGATGCTCAAATTGCTACAAAAAAAAATATGCAGTGGAGACTTCGGGGATTCCTTTCCTTCGTCGTTGCGCCTTGTATTATCTTCAGCATATAATATTAGATTATTTTACAAATCAAATCCTTCTGAAACTCTTGAAAGGTTGTTTCAGATGTGCATTGCTCTCATTGAACACTACATAGAAAATTTTTTGGTGGTAGAACATGTCATTGGAATTTCAGACAATCGAGGAATTTCTGATCAGACAAAATTTATTCAGGAACTAATGGAGCTCATAGTTCTCCATCCGGTGGTTACCGAGTCCTTACTGAACCCTTTGTTCTACACTAGTATCGTCCTAATGGAAAAAATGTTGGGAAATTTTGAAGATTTTATTGTTTTATCAAAGAAAACTTTTCATCCATTTGACAGTTCCATCTTACATATTTTTAAGAGACTAGTTGATTTTTTGATAACTCTTAAAGATGGGCAGAAATCCGTGTGTAATATTTTTTCTGTCTCTGCATCACTCAGAAGGAAAATTAAGAATATCTTGCATTATTGTGTTGATTCTTTCAAGAAAAATTTTGAAATTTGTGTAGAAATGAAAGATCTAATGCCTTTTCTTCCAAATTTTTGTATTTTATATGGACTCATGGATCTTATATCTCCAAATGATTTGTTGGAACTGGTGTATTGGATGCTTTCCAAGATTGATCGTCATCTTATTGGTTGGAAATTTCCAAGGATGTCAGCTCTATCTGTTGCTCTTTGTATTGCAATTAACACTTTTAAATTATTCTCTGATATTCAATTCTTAAATAAGACTCATCATTTTTTTTTGGGATCAACAGACATTAAACACACAGTGCCCCTTAAAAATGTGTTTTCTATGATTCTACAATTCAGCAAAGATTTTAACCTGGAACTAGCTGATACATGTTTATTGAAAGCTGTGGATCTCGTATACAATCAGAGATTTTCAAGACCAACTGCTAACTTTCAATTTTGTATGCTTATGTCAAGAACTTTTATTTGCAGCCATGTGGAAATTCTCAAACATTGCATCTACAAACCTAGCAAGATAAAATCAGTACTACTATTCAAGCTTACGGAAATTATTCCTCTTCACTCAAGATTTTTAGGCACGATTTTGTTTGATATTATCGATAAGTATCCTTCTTCTAGTGTAGATGTCTCAATGCCACCAAAGGGTTTGGATACCATGACAGATTCCAGTTATGCATTTACACCTGAAGACTTCATTCTACTACTACCTTCAGCTTTATCATTTCATAAAGCTAGTTTGCTCAGGGGACGTGATCAAGAAATGTCTTTGGTTATCCTAACATTTTATTCCAGAATATTGTTAGACAGTTGTTCAAATTGGAAGAATTTTTTTTCTACAAGTTTATTTTATGAAGATAACACTGACTTGATTTTAAAACCAAACGATTTTCAGTTTACTTTTCATAATACTCTGCTTGGGAAAGCTGTTTGTATGCTACAAAGTTTCTTTTTCCTAAGTCCGGATTCTATTACAAGGAAGCAACGTCTAAAATATTTTGATTCAATGTATACTTCAGATGAGTTGTTTTCAGGCTTTGATACTTTGGACAATAAAAAACAGCCATGTCTAGATTTGTTTAATTTTGTTAATAGAGTTATTGGGAAGATATCATTTTCATGGCTGTTGCTTTTTCCTGAAGACGTACCTTTAAAGTGCAAAGAGGATGTAAGAGAAACCTCAATTAGAAAAGAATATAAAAGGGAAAATTGTGCAAAGCTAAAATTTATGGACCATCTAGCTTGTTTTTTGGATAAGATTGTTAAAAATACACCTTTCAAGTTGGATTCTTGCAATGGATCAAATTCTTCCATCTGGTTTCAATTAATGCGATTTCTAGAGGTTTCCATCTTAGGCAGCATTGTTCGATTGGCTACAAAAAATAATAATTTTCTTATTCAGTCATCTTCTACTGTTTTTCCGGAAGTATTTATCAAATCCTCTCTCCTACACAGGTTTGATGATCCCCACACTATCAGTCAAATACGCAACATTCTTAATGCACTAAAGGGAAGATTCAATCCGGTTGAAGTTTTGGAGCTTCTTCTTGGACATTCAAAATTTGTGCATGTTATTCACAGTGACAATTCATTCCCCCCTTCATCTGGTTTGGTTGAAACCGGGACATTTTTACAGACATTGCCTAGCTTATTTGAATCGATTGGTTCATCTTTTGGATATGGATTATTGGAGTCTAAGAGTCAATGTTTTGACTTTGGAAATGAGGAGCATTTTCAAGAGAACATTAAATTGCAACTTGTTAAGCTCCTCAGATTTTTGTATCCTCTTGCAGTGCCACATAATGATTATAGTGCTGTCAGTATGAATAAGAAAGAATTATTTTCTTTACTTTTATCTGGATATGGAGCATCTTTGAGTGAAACTGATGTTGAAACCTTCCGGCTTATACTTGAGATTGAGTCGATTGAAAAACAAAGTGCTGTAACTATTTCAAGCATGGACTATCTTTGGGGCACTTCTGCTTTAAAACTACAAAAAGAAGATAAGCTTGATAAATTGATGAATGACAACAGAAATAATGATTGTGAAACCGTCCAGGATAAATCAAGAAGGATTTTTAGAGATAATATCTTGATTGATTCAAGAATGTGCACCACCACTGTGCTTAACTTTAATTTGACATATTTGCCTGATACATATTGTTCACAGCAATCAAGGTTGGCACATTTTGCTAAAATGTATGATCCAAGCTTCATGTTACGAATGTCTGATAATTGTTTGCGGAAAAGCTTTATTGATCCACTCGAGTTTATACGGATGGGATTGCTTGCATATGCATTGATCAATATTTCTTCACCGAATCAAGATTTTCGTATTTTAGGTTACGAGGTTCTTATTTCTTTTCCAAAAGCTGTGATGAATCATCATAAGAAAAATGACCTATTGCAAGTTCAGCTTCTATTGACATATTTGCAAAATGGGATAACAGAGCCATGGCAAAAAATTCCATCTATTATTGCGATATTTGCTGCAGAAGCATCTTTTATATTGTTGGATAATTCTCATGTCCACTTCCAGACTATACGTAATCTGTTGACGGAATCTCGTAAAGTTGATTTAAAGAAAATCCCTTTATTTGATACTTTCTTTAAGCAGTCAGTTAAGGAAAGCTCTTTCAATTCTAGAAGAGTGCGCTTGTGGATTCTGCAGTTGATATATGCTGGACTAAATCAAGATGATGATGCCCAAATTCTTATGATTGGCTTTGTCATTGAATATTTGCTGATCTTTTATGTATCTTCTCTTTCAGATGCAGAATCAAAAATTCTTATTCTTCAGATATTGAAGAAATCTGTAAAGTTGCATAAATTAGCTTGCCGTTTGGTCATGGATGGTGGTCTTATTTCGTGGTTATTTTCTGATTTAGTATTGCATGGTAAGATGCTCTTGGGTGATGAGAAGGGAATTTCCATCAAACAATTAGAAATTATTTTGGAGGTAATCCTTGTAGTGCTGTCTTTAAGAACTATCACTGAATGGTTGAAAAATGAAGCACTTGAGCAGCTGTCAGAAGTTTCTTCTTATCTTCTTAATCTTCTTGTTAGTTCTCTGGGAATATTGAAGGAAAGCATCAGATTAATCAATTCTATTTTTGATGTTATTTCTTCAACTTTAAAGATTTCACAAAAAAGAAAAGTTTACATCTCTCATTTTACTGTGTCACTTGATACACTATTTCAATGTTACCAAGTCATGGACAAAGAACTCAGGCATACAATGTTCAATGAGACTTATGAACTAGGACTAAGAACCTTGCTAATGTGCACACCTCCATCTATCATTTTTTCAACGGATAAAGCAAAACTAGCAAAGTTAGTTTTCCAGGCCATTTCCTATACTTTGATATCACATTGTGGAAAAGTTCATTTACGTGATGAAAAGTCTGCGAGTTCGAAGAATGATGAATCATATCCTCATAAGCTTTTACGTTGGATTACTGCATCAGTTATTATGGGATTCATTTCTAGTCGAAAGCCTGAAACAAATTTATCTTTGCAAAGAAAGGAAGAAAACCTCCGAACACTTGTTCAAAATACGATAATGGAGAAGATAGAAGATTATGAAAGCAAGGATGCAGACTTTAACATTAATCGGGCTTTGTCTTCTTTAATTTTATACCTTTGCCAGCTGTTTGCAATGGAATCGACCCTTCTCCCTTCCATAGTCTTTGCTCTTTGCTTGTTGTTTCCCAATGACAACCAGAACACTGATGTTAAGGATCTATTATCCGGAGAGTTGTGCTCAAAGATACGATGCCCAGCTGAAGTTAATGCTAATTGGAGATGGTCATTTTATGGGCCTTGGGAAGACAGGACTGGTGAGCAAACAAGCTTAGAGTGTCTAGAGGAAGCACAAGCATGCCAGACACTTTTGTTCGCTTTTTCAAATTCATTATGA
Protein:  
MDEQVEVVAMTTLKVLLKNVLSTEFEIYSEASKDLAKLFKRDSCGELLRQYIRSSENCMELLEIWKMRRGKPGMVYVFKLITAVLDHSFGKSRMSGIMRNLDSFARGIIFEKLEDVYLEMKSEQAKRQNAALRLLASIVRRGTGLASDVEKTFDFDLSVLPKLSGNQKVKWKKYHETYSTRNSFVRFAMSFLEVGNPRLLGIVIRHKVLYAGVLQGLTKDDSDTLVYVLSILKDRVLPSSSLIRPGLRSLLFGEGTLEQLSLISGNLEGGHASDLAHEVLVMVCTDPCNGLMPNSNLMGNKKRLLKFMFKLKAIEVIYHKDLLLTVVKGKPFLCAKYLKKFPYNLDPNMSPEWFSAISLTTDLISSTISSFTFNFLSSTSSHDPPDFKGKEMQYILKSILPNLFTRSVCNKGLLHTDILVKHGALRLVLEILKALDKFSIQIDLVAKINCSDEVGCFESVPVDWNGPSGFGFFGNNFCYNFHPKSHIAPKNDQSLMQKWMSFKQDLQDEVGNFLPDLQVLLNLLASSQRMIKSSLNIEGSRDSRFNIKRCLHLPEVSRKRLKSSTSSISDGVDIIISGVNLENNYNTLEENNDVKVSEDMELEETNVKMLVDEIWGSSKADIITTKTEDLDIFFYTKLLDTLALYIKRVPKALGGSFDFFKILPDDPSSLSSFHLDSVLSLLVEYTGQSSVSNHPVRVPDMMYKHLLPLINLLSHTQGGTQDKAYVLVRSAMLSTGAFDQNVSEIDVWLLFLPSHCEKENYASKKKTNNKWVIIVISFLCDAVSTIGNNLFKKWDHMRVLISQLKEFRDEVPTYSPLVPIIIEKCIRLLKSDSGSFKLFEKTMVSLYVCNSLIYLLQSQALPGSLPHLINLLLSEKSNNTYIMDDDSNNSQWRPVKSLLYSARCILHQQSSDHLLYIPEKIKKGNGGLLYSALNSVKEILASEHKLDLDEAAVSLLSSVICATLDDILNYFPLLVIVVEQLWGAHTQILSSILFCEWNVLSVVSNLRPDMLFSSLDGIEDTMSNNHESATTTSISIWETIPFHSIFTLATILCKCNVVLSTKMLKLLQKKICSGDFGDSFPSSLRLVLSSAYNIRLFYKSNPSETLERLFQMCIALIEHYIENFLVVEHVIGISDNRGISDQTKFIQELMELIVLHPVVTESLLNPLFYTSIVLMEKMLGNFEDFIVLSKKTFHPFDSSILHIFKRLVDFLITLKDGQKSVCNIFSVSASLRRKIKNILHYCVDSFKKNFEICVEMKDLMPFLPNFCILYGLMDLISPNDLLELVYWMLSKIDRHLIGWKFPRMSALSVALCIAINTFKLFSDIQFLNKTHHFFLGSTDIKHTVPLKNVFSMILQFSKDFNLELADTCLLKAVDLVYNQRFSRPTANFQFCMLMSRTFICSHVEILKHCIYKPSKIKSVLLFKLTEIIPLHSRFLGTILFDIIDKYPSSSVDVSMPPKGLDTMTDSSYAFTPEDFILLLPSALSFHKASLLRGRDQEMSLVILTFYSRILLDSCSNWKNFFSTSLFYEDNTDLILKPNDFQFTFHNTLLGKAVCMLQSFFFLSPDSITRKQRLKYFDSMYTSDELFSGFDTLDNKKQPCLDLFNFVNRVIGKISFSWLLLFPEDVPLKCKEDVRETSIRKEYKRENCAKLKFMDHLACFLDKIVKNTPFKLDSCNGSNSSIWFQLMRFLEVSILGSIVRLATKNNNFLIQSSSTVFPEVFIKSSLLHRFDDPHTISQIRNILNALKGRFNPVEVLELLLGHSKFVHVIHSDNSFPPSSGLVETGTFLQTLPSLFESIGSSFGYGLLESKSQCFDFGNEEHFQENIKLQLVKLLRFLYPLAVPHNDYSAVSMNKKELFSLLLSGYGASLSETDVETFRLILEIESIEKQSAVTISSMDYLWGTSALKLQKEDKLDKLMNDNRNNDCETVQDKSRRIFRDNILIDSRMCTTTVLNFNLTYLPDTYCSQQSRLAHFAKMYDPSFMLRMSDNCLRKSFIDPLEFIRMGLLAYALINISSPNQDFRILGYEVLISFPKAVMNHHKKNDLLQVQLLLTYLQNGITEPWQKIPSIIAIFAAEASFILLDNSHVHFQTIRNLLTESRKVDLKKIPLFDTFFKQSVKESSFNSRRVRLWILQLIYAGLNQDDDAQILMIGFVIEYLLIFYVSSLSDAESKILILQILKKSVKLHKLACRLVMDGGLISWLFSDLVLHGKMLLGDEKGISIKQLEIILEVILVVLSLRTITEWLKNEALEQLSEVSSYLLNLLVSSLGILKESIRLINSIFDVISSTLKISQKRKVYISHFTVSLDTLFQCYQVMDKELRHTMFNETYELGLRTLLMCTPPSIIFSTDKAKLAKLVFQAISYTLISHCGKVHLRDEKSASSKNDESYPHKLLRWITASVIMGFISSRKPETNLSLQRKEENLRTLVQNTIMEKIEDYESKDADFNINRALSSLILYLCQLFAMESTLLPSIVFALCLLFPNDNQNTDVKDLLSGELCSKIRCPAEVNANWRWSFYGPWEDRTGEQTSLECLEEAQACQTLLFAFSNSL